DNA helicase II (PA5443)
| Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Name: | DNA helicase II | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Name: | uvrD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Enzyme Class: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General Function: | Replication, recombination and repair | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Specific Function: | Has both ATPase and helicase activities. Unwinds DNA duplexes with 3' to 5' polarity with respect to the bound strand and initiates unwinding most effectively when a single-stranded region is present. Involved in the post-incision events of nucleotide excision repair and methyl-directed mismatch repair | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Location: | Cytoplasmic | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Pathways: |
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| KEGG Reactions: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMPDB Reactions: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PseudoCyc/BioCyc Reactions: |
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| Complex Reactions: |
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| Transports: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolites: |
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| GO Classification: |
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| Gene Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Locus tag: | PA5443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Strand: | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene ID: | 877766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Accession: | NP_254130.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GI: | 15600636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence start: | 6131088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence End: | 6133274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence Length: | 2186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Sequence: |
>PA5443 ATGAACGACGACCTCTCCCTCCTGCTGAACTCCCTCAACGACCCGCAGCGCCAGGCCGTGGCCGCGCCGCTGGGCCGCCAACTGGTCCTCGCCGGCGCCGGCTCGGGCAAGACCCGCGTGCTGGTGCACCGGATCGCCTGGCTGATCCAGGTCGAGCACGCCTCGCCCTACAGCATCCTGTCGGTGACCTTCACCAACAAGGCGGCGGCGGAGATGCGCCACCGCATCGAGCAGTTGCTCGGGATCAATCCGGCGGGCATGTGGGTCGGCACCTTCCACGGCCTCGCCCATCGCCTGCTGCGCGCGCACTGGCGCGAGGCCGGGCTGAGCGAGAACTTCCAGATCCTCGACAGCGACGACCAGCAACGCCTGGTCAAGCGGGTGATCCGCGAACTCGGCCTCGACGAGCAGCGCTGGCCGGCGCGCCAGGCCCAGTGGTTCATCAACGGGCAGAAGGACGAGGGCCTGCGGCCGCAACACATCCAGCCCGGCGGCGACCTGTTCCTCGCCACCATGCTGAAGATCTACGAAGCCTACGAGGCGGCCTGCGCCCGCGCCGGGGTGATCGACTTCTCCGAGCTGCTGCTGCGCGCCCTGGACCTCTGGCGCGACCATCCCGGCGTGCTCGAGCACTACCAGCGGCGCTTCCGCCATATCCTGGTGGACGAGTTCCAGGACACCAACGCCGTGCAATACGCCTGGCTGCGGATTCTCGCCAAGGGCGGCGACAGCCTGATGGTGGTCGGCGACGACGACCAGTCGATCTACGGCTGGCGTGGCGCACGGATCGAGAACATCCAGCAGTTCAGCGACGACTTCGCCGATGCCGAGGTGATCCGCCTGGAGCAGAACTACCGTTCCACCGCGTCGATCCTCAAGGCCGCCAACGCCCTGATCGCCAACAACCAGGGACGCCTGGGCAAGGAGTTGTGGACCGACGGCGAGGACGGCGAGTCGCTGAGCCTGTACGCCGCGTTCAACGAGCACGACGAGGCGCGCTACGTGGTCGAGTCGATCGAGAGCGCGCTCAAGGGCGGCCTGGCGCGCAGCGAGATCGCCATCCTCTACCGCTCCAACGCCCAGTCGCGGGTGCTGGAGGAAGCCCTGCTGCGGGAGAAGATTCCCTACCGCATCTACGGCGGCCAGCGCTTCTTCGAGCGTGCCGAGATCAAGAACGCCATGGCCTACCTGCGCCTGCTCGACGGCCGCGGCAACGACGCGGCGCTGGAACGGGTGGTCAACGTGCCGGCACGCGGCATCGGCGAGAAGACCGTGGAGAGCATCCGCGAATTCGCCCGCGGCAACGATGTGTCGATGTGGGAGGCGATCCGCCTGATGATCGCCAACAAGGTCCTGCCCGGCCGCGCCGCCAGCGCCCTGACCGGCTTCGTCGAGCTGATCGAGAATCTTTCGGCGAAGGTCATGGACATGCCGCTGCACCTGATGACCCAGACGGTGATCGAGCAGTCCGGACTGATCAGCTACCACAAGGAAGAAAAAGGCGAGAAAGGCCAGGCCCGGGTGGAGAACCTCGAGGAACTGGTCAGCGCCGCCCGCGCCTTCGAGAACAGCGAGGAAGAGGAAGACCTCACCCCGCTGCAGGCCTTCCTCAGCCACGCCTCCCTGGAGGCCGGGGAAACCCAGGCCGACGCCCACGAGGACAGTGTCCAGCTGATGACCCTGCACAGCGCCAAGGGCCTGGAGTTCCCGCTGGTGTTCCTGGTCGGCATGGAGGAAGGGCTGTTCCCGCACAAGATGAGCCTGGAGGAATCCGGCCGCCTGGAAGAGGAACGCCGCCTGGCCTACGTCGGCGTCACCCGCGCCATGCAGCGACTGGTCCTGACCTACGCGGAGACCCGCCGGCTCTACGGTAGCGAGACCTACAACAAGGTTTCGCGCTTCATCCGCGAGATCCCGCCGGCGCTGATCCAGGAAGTGCGCCTGTCCAATACCGTCAGCCGCCCCTACGGCGGCACCTCGCGCAGTGCCGGCGGCAACCTCTTCAGCGGCGCCGGGGTGCCGGAGACGCCCTTCTCCCTCGGCCAGCGGGTGCGCCACGCGCTGTTCGGCGAAGGGACTATCCTCAACTTCGAAGGCGCCGGCGCCCAGGCCCGGGTGCAGGTGAATTTCGAGAGCGAAGGCAGCAAGTGGCTGATGCTCGGCTACGCCAAGCTGGAAGCCCTGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Residues: | 728 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Molecular Weight: | 81.5 kDa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Theoretical pI: | 5.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Hydropathicity (GRAVY score): | -0.283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Charge at pH 7 (predicted): | -13.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Sequence: |
>PA5443 MNDDLSLLLNSLNDPQRQAVAAPLGRQLVLAGAGSGKTRVLVHRIAWLIQVEHASPYSILSVTFTNKAAAEMRHRIEQLLGINPAGMWVGTFHGLAHRLLRAHWREAGLSENFQILDSDDQQRLVKRVIRELGLDEQRWPARQAQWFINGQKDEGLRPQHIQPGGDLFLATMLKIYEAYEAACARAGVIDFSELLLRALDLWRDHPGVLEHYQRRFRHILVDEFQDTNAVQYAWLRILAKGGDSLMVVGDDDQSIYGWRGARIENIQQFSDDFADAEVIRLEQNYRSTASILKAANALIANNQGRLGKELWTDGEDGESLSLYAAFNEHDEARYVVESIESALKGGLARSEIAILYRSNAQSRVLEEALLREKIPYRIYGGQRFFERAEIKNAMAYLRLLDGRGNDAALERVVNVPARGIGEKTVESIREFARGNDVSMWEAIRLMIANKVLPGRAASALTGFVELIENLSAKVMDMPLHLMTQTVIEQSGLISYHKEEKGEKGQARVENLEELVSAARAFENSEEEEDLTPLQAFLSHASLEAGETQADAHEDSVQLMTLHSAKGLEFPLVFLVGMEEGLFPHKMSLEESGRLEEERRLAYVGVTRAMQRLVLTYAETRRLYGSETYNKVSRFIREIPPALIQEVRLSNTVSRPYGGTSRSAGGNLFSGAGVPETPFSLGQRVRHALFGEGTILNFEGAGAQARVQVNFESEGSKWLMLGYAKLEAL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links: |
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| General Reference: | PaperBLAST - Find papers about PA5443 and its homologs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
